「울고 있는 사람이 있다면, 리셋합니다」 “슬픔”과 “후회”를 없애기 위해, 우리들은 과거를 다시 시작한다. 주민의 절반이 특수한 능력을 가진 마을 “사쿠라다” 아사이 케이는 「기억유지」능력을 가진 고등학생으로, 케이와 함께 행동하는 하루키 미소라는 세계를 최대 3일 전까지 되돌리는 「리셋」능력을 가지고 있다. 「리셋」을 하면 하루키는 자신의 기억도 전부 잊게 되지만, 케이의「기억」은 절대로「리셋」되지 않아 두 사람이 함께 능력을 쓰면 세계를 최대 3일 전까지 다시 시작할 수 있다. 하지만 그런 케이와 하루키에게도 돌이킬 수 없는 “과거”가 있었다. 그것은 2년 전,「리셋」의 영향으로 죽은 동급생, 소마 스미레에 관한 것이었는데. 어느 날 케이는 소속된 “봉사클럽”에서 고등학교 봉사활동의 일환으로 의뢰를 받는다. 능력을 빼앗겨버린 사사노의 의뢰를 받은 케이는 유폐당한 “마녀”와 만나게 되는데…